Tras la instalación del software TCOS en la modalidad de profesor, nos aparecerá una aplicación más, accesible desde el botón de inicio → Administración. Se denomina "TcosMonitor", desde la que realizaremos la configuración y podremos comenzar a controlar nuestro aula. También nos habrá creado un icono en el escritorio para tener a mano dicho software.
La primera vez que lo ejecutemos, nos advertirá que no hemos establecido un usuario y clave con el que conectar con los alumnos, por lo que debemos configurarlo (ver más abajo).
Pulsamos "Aceptar", mostrándonos información sobre las personas implicadas en el proyecto, así como la versión y licencia del software.
Cerramos esta ventana, mostrándonos el programa, todavía si ningún equipo conectado. 
En la pestaña de "Configuración", debemos cambiar el método de escaneo de equipos por "ping", que será el protocolo utilizado para encontrar los equipos de los alumnos de forma automática y sin necesidad de indicarle las direcciones IP de los mismos.
Además, es conveniente marcar la opción "Sólo hacer acciones para equipos seleccionados", que permite marcar aquellos equipos sobre los que queramos hacer una determinada acción, para ello, aparece una nueva columna en la ventana principal del programa con casillas de verificación para seleccionar los equipos.
Pasamos ahora a la pestaña "Autenticación".
Aquí debemos poner el usuario y clave que establecimos cuando configuramos los equipos de los alumnos. Recordemos que en el ejemplo utilizamos el usuario root y la clave cmadrid, pero que era muy recomendable utilizar un usuario y clave propios y no tan evidentes para evitar posibles usos malintencionados del programa.
Pulsamos "Aceptar" para guardar la configuración. Y esto es todo. Ahora, para comenzar la búsqueda de equipos de alumnos (deberán estar encendidos), pulsaremos el botón "Actualizar".
